Au cours d'un voyage de 9 mois, l'équipe Cousteau explorera le plus long fleuve de la planète : le Nil. Il coule vers le nord jusqu'à la Méditerranée, traverse la moitié d'un continent et plus de 7000 ans d'histoire. Sur ses rives, les civilisations ont construit des merveilles d'architectures. Les royaumes se sont érigés, puis sont tombés, le destin de chacun toujours intimement lié à celui du fleuve… sans que nul ne s'en soit rendu maître. L'équipe de la Calypso étudie la vie autour du Nil, demeurée presque inchangée depuis l'époque des pharaons.