Koyomi Araragi se réveille un matin avec une drôle d'impression, comme si quelque chose n'allait pas. Toujours perturbé, il décide d'aller voir ses amies et ainsi comprendre ce qui lui arrive. Au fur et à mesure, il va rapidement se rendre compte qu'il se trouve dans un univers parallèle où certains événements qu'il a connus n'ont pas eu lieu.